博物馆成立前, 1949年至1980年5月间,武进的文博工作由文化馆兼管;
1980年5月至1983年2月间,全县文博工作改由县图书馆兼管;
1983年2月,武进县博物馆成立后,因无办公之地,仍与县图书馆合署办公;
1985年9月,武进县博物馆搬迁至湖塘新街202号;
现新馆位于春秋淹城旅游服务区,始建于2006年10月,2007年9月竣工;
2007年12月,常州市武进区博物馆与常州市武进区淹城博物馆合署办公,一套班子,两块牌子,新馆于此时正式投入使用;
2009年1月,常州市武进区名人馆划归常州市武进区博物馆管理。
2019年10月,常州市武进区晓园艺术馆划归常州市武进区博物馆管理。